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Hogan Saldi Caserta 29 inibisce la formazione di coagulo

Hogan Saldi Caserta

Trombina, una serina proteasi multifunzionale, riconosce più substrati macromolecolari e svolge un ruolo fondamentale sia procoagulante e funzioni anticoagulanti. La specificità di substrato della trombina coinvolge due superfici elettropositivi, il fibrinogeno-riconoscimento e exosites-eparina vincolante. Il processo SELEX è un potente metodo combinatorio per identificare ligandi ad alta affinità oligonucleotidiche a qualsiasi porta. Il processo SELEX è stato usato per isolare ligandi di DNA a singolo filamento alla trombina umana. Qui, un 29-nucleotide legante il DNA a singolo filamento di trombina umana, designato 60-18 [29], con una Kd di circa 0,5 nM è descritto. DNA 60-18 [29] inibisce la formazione di coagulo di fibrina trombina-catalizzata in vitro. Leganti DNA precedentemente descritte vincolano il exosite fibrinogeno-riconoscimento, mentre esperimenti di competizione e photocrosslinking indicano che il ligando DNA 60-18 [29] si lega il exosite-eparina vincolante. DNA 60-18 [29] è un quadruplo / duplex con un 15-nucleotide 'core' sequenza che è sorprendente somiglianza Hogan Saldi Caserta con leganti DNA precedentemente descritti per la trombina, ma si lega con da 20 a 50 volte più alta affinità. La sequenza nucleo 15-nucleotide ha otto residui di guanina altamente conservati e forma una struttura G-quadruplex. Un singolo nucleotide nella struttura G-quadruplex può dirigere il DNA per un epitopo distinto. Ulteriori informazioni sulla sequenza nelle regioni duplex di ligando 60-18 [29] contribuiscono a Hogan Napoli una maggiore stabilità e affinità di legame con trombina. È stato proposto un modello a bassa risoluzione per l'interazione di 60-18 DNA [29] per trombina umana.
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